Где делали анализы и какие? Откуда Вы?
Странно читать про "небольшую неперевариваемость клетчатки". У кролика все горошки почти полностью состоят из непереваренной клетчатки. А анализ на дисбактериоз делают только в специализированных лабораториях. К тому же норму у кроликов вряд ли кто знают.
Сколько даете корма и сена?
Какие у нее горошки? Мягкие/твердые, влажные/сухие ?
Можно попробовать подавать пробиотики - Кроликам, по словам врачей, больше подходит Про-колин (пробиотик для кошек/собак) давать по 0,5мл/кг 3 раза в день. Или человеческий Линекс давать по 1/5-1/4 содержимого капсулы 2 раза в день.

Может, "хочуха" просто? У меня у самочки лоток периодами действительно приобретает более резкий запах, а потом это проходит само по себе.

Заинтриговалась и собрала у зайцев горохи на обнюхивание    . Действительно, утренняя порция - уже не пахнут ничем, как ни принюхивалась. А вот свежие, "с пылу, с жару" и у Зайкина, и у Беллы имеют легкий запах, притом у каждого свой) Запах не резкий, в нос точно не бьет, у Зайкина даже мускусный какой-то амбре .
Теперь повнимательней присмотрюсь, вернее, принюхаюсь к Изабеллиному горшку, возможно, и правда, запах только от мочи...

Уж очень широкая специализация. Даже не знаю хорошо это или плохо.
Меня уж больно сильно насторожила интерпретация анализа кала. По общему анализу кала у кролика можно определить только скрытую кровь. Все остальное сильно зависит от того, что ел кролик накануне, а уж непереваренной клетчатки там будет 40-60%. Анализ на дисбактериоз вообще положено сдавать в стерильных контейнерах, и брать образцы сразу на "выходе" стерильным инструментом (знаю случай, когда по неправильно взятому анализу кролика долго лечили от грибков, которые в норме живут на коже человека). И делается такой анализ дней 12-14. И все равно он будет не показателен, т.к. дисбактериоз у кролика проявляется в работе слепой кишки, поэтому для анализа правильнее брать свежие цекотрофы.

Да все в норме.
Есть клетчатка (может даже маловато, чаще ++) ставят. Непереваримая клетчатка все в норме.
Яйца глист (я/г)- нет,
простейших - нет (может быть плохо искали или кал был не самый свежий - у кроликов почти всегда есть какие-нибудь простейшие, но живыми их можно найти только в свежем кале),
палочки и коки (П/К) есть в соотношении 1:5 (сколько должно быть в норме - нигде нет информации, у человека 1:2 - 1:3, но человек не кролик).
Что написано про грибки - я не понял. Но если анализ брали не стерильный, туда могло занестись из-вне что угодно.

К сожалению,Найденова не работает сейчас в "Красном Лисе".Так мне сказала администратор клиники,добавив,что в Петербурге ее тоже нет.Попробуйте найти ее через ВКонтакте.Может она ответит?
По поводу горошков.Для анализа подходит только свежий кал сроком час-два.Это для определения паразитов.На дизбактериоз сдаются цекатрофы,и тоже только свежие.Я однажды несколько часов ждала,когда Кром соблаговолит предоставить и то,и другое,а потом пулей летела в клинику.чтобы анализ был верным.С Кузенькой так же.Так что запасайтесь терпением,или лучше накормите малыша уже будучи в клинике,и дождитесь горошков.